Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LHX9Q9NQ69 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms