Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC28A3Q9HAS3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC28A3Q9HAS3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms