Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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