Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMYD3Q9H7B4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMYD3Q9H7B4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms