Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCAS3Q9H6U6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms