Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAP3Q9H6T3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAP3Q9H6T3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms