Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXF3Q9H4D5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF3Q9H4D5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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