Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLR1EQ9GZS1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms