Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THSD7BQ9C0I4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THSD7BQ9C0I4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms