Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LNPKQ9C0E8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LNPKQ9C0E8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms