Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM6Q9C030 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM6Q9C030 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms