Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM31Q9BZY9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM31Q9BZY9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms