Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms