Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPF3BQ9BZI7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPF3BQ9BZI7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms