Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUS3Q9BZE2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PUS3Q9BZE2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms