Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms