Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL3Q9BXA9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms