Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf16Q9BUW7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf16Q9BUW7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms