Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDC1Q9BTX1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDC1Q9BTX1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms