Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT11Q9BT88 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT11Q9BT88 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms