Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM175Q9BSA9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM175Q9BSA9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM175Q9BSA9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms