Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GINS3Q9BRX5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms