Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms