Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDF4Q9BRK5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms