Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACBD6Q9BR61 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACBD6Q9BR61 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACBD6Q9BR61 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms