Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms