Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUSP9Q99956 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms