Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPAT1Q99943 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGPAT1Q99943 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms