Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRG3Q99928 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRG3Q99928 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms