Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPAS2Q99743 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms