Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKP4Q99569 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKP4Q99569 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms