Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK5RAP2Q96SN8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK5RAP2Q96SN8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK5RAP2Q96SN8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms