Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPXM1Q96SM3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPXM1Q96SM3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms