Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSRNP1Q96S65 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSRNP1Q96S65 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms