Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHF12Q96QT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms