Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP4Q96PP9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP4Q96PP9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms