Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUHP3Q96NS8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms