Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL15Q96M94 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL15Q96M94 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms