Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS50Q96JG6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPS50Q96JG6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms