Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZNF479Q96JC4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms