Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC11Q96J66 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms