Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMARCD1Q96GM5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCD1Q96GM5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms