Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTERF3Q96E29 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTERF3Q96E29 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms