Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C18orf8Q96DM3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf8Q96DM3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms