Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C12orf43Q96C57 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C12orf43Q96C57 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms