Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSR2Q969E8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSR2Q969E8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms