Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNPO1Q92973 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms