Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CSRNP3Q8WYN3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CSRNP3Q8WYN3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSRNP3Q8WYN3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms