Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNAAF4Q8WXU2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNAAF4Q8WXU2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms