Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPIRE2Q8WWL2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIRE2Q8WWL2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms